Toxic R-loops: Cause or consequence of replication stress?
Samira Kemiha, Jérôme Poli, Yea-Lih Lin, Armelle Lengronne, Philippe Pasero
Bases moléculaires de pathologies humaines
Le corps humain est constitué de 3.7x1013 cellules, contenant chacune environ deux mètres d’ADN. Sachant que nos cellules font un total de 1016 cycles de division cellulaire au cours de notre existence, elles synthétisent donc plus de 2x1016 m d’ADN, ce qui représente 130 000 fois la distance de la terre au soleil! Cette tâche considérable est assurée par des micro-machines appelées réplisomes, contenant plusieurs centaines de protéines. Les réplisomes sont assemblés au niveau des origines de réplication et génèrent des structures d’ADN appelées fourches de réplication. Au cours de leur déplacement le long des chromosomes, les réplisomes rencontrent souvent des obstacles tels que des lésions de l’ADN ou des complexes de transcription, entrainant un arrêt des fourches de réplication. Les fourches bloquées sont des structures fragiles, pouvant induire la formation de cassures de l’ADN et une instabilité génétique si elles ne sont pas rapidement redémarrées. Le blocage des fourches est encore plus fréquents dans les cellules tumorales suite à la dérégulation de voies oncogéniques, ce qui provoque un stress réplicatif. Ce stress réplicatif induit par les oncogènes joue un rôle central dans la tumorigenèse en induisant de l’instabilité génétique. Cependant, il représente aussi le talon d’Achille de la tumeur car il ralentit la prolifération des cellules et les rend plus sensibles à la chimiothérapie. Comprendre comment les cellules normales et tumorales répondent au stress réplicatif représente donc un enjeu majeur en cancérologie.
Notre équipe étudie les mécanismes de réponse au stress réplicatif chez la levure et dans des lignées de cellules humaines. Compte tenu de la petite taille de son génome et de la puissance des outils de génétique moléculaire, la levure S. cerevisiae est un modèle de choix pour caractériser de nouveaux mécanismes de réponse au stress et étudier ensuite leur rôle dans les cellules tumorales. Pour ce faire, nous utilisons des technologies de pointe permettant de suivre la progression, l’arrêt et le redémarrage des fourches. Il s’agit notamment d’approches ‘molécule unique’ comme le peignage moléculaire, de techniques permettant d’étudier la structure des chromosomes par électrophorèse en champs pulsés et d’approches pan-génomiques (séquençage à haut débit), comme le ChIP-seq, le BrdU-IP-seq, le DRIP-seq et le BLESS. L’utilisation combinée de ces différentes approches permet d’avoir une vision globale de la réponse au stress réplicatif chez la levure et l’Homme, de la molécule d’ADN unique au génome entier.
Afin d’explorer l’impact potentiel de ces nouvelles connaissances pour le traitement du cancer, nous nous sommes récemment associés à l’équipe de Jérôme Moreaux (Service d’Hématologie du CHU de Montpellier), qui est un expert reconnu dans le domaine des hémopathies malignes et notamment du Myélome Multiple.
Samira Kemiha, Jérôme Poli, Yea-Lih Lin, Armelle Lengronne, Philippe Pasero
Forey R, Barthe A, Tittel-Elmer M, Wery M, Barrault MB, Ducrot C, Seeber A, Krietenstein N, Szachnowski U, Skrzypczak M, Ginalski K, Rowicka M, Cobb J, Rando OJ, Soutourina J, Dubrana K, Gasser SM, Morillon A, Pasero P, Lengronne A and Poli J
Promonet A, Padioleau I, Liu Y, Sanz L, Biernacka A, Schmitz AL, Skrzypczak M, Sarrazin A, Mettling C, Rowicka M, Ginalski K, Chedin F, Chen CL, Lin YL, Pasero P
Benjamin Pardo, María Moriel‐Carretero, Thibaud Vicat, Andrés Aguilera and Philippe Pasero
Romain Forey, Ana Poveda, Sushma Sharma, Antoine Barthe, Ismael Padioleau, Claire Renard, Robin Lambert, Magdalena Skrzypczak, Krzysztof Ginalski, Armelle Lengronne, Andrei Chabes, Benjamin Pardo, Philippe Pasero
Delamarre A, Barthe A, de la Roche Saint-André C, Luciano P, Forey R, Padioleau I, Skrzypczak M, Ginalski K, Géli V, Pasero P, Lengronne A
Combes E, Andrade AF, Tosi D, Michaud HA, Coquel F, Garambois V, Desigaud D, Jarlier M, Coquelle A, Pasero P, Bonnefoy N, Moreaux J, Martineau P, Del Rio M, Beijersbergen RL, Vezzio-Vie N, Gongora C
Bianco JN, Bergoglio V, Lin YL, Pillaire MJ, Schmitz AL, Gilhodes J, Lusque A, Mazières J, Lacroix-Triki M, Roumeliotis TI, Choudhary J, Moreaux J, Hoffmann JS, Tourrière H, Pasero P
Herviou L, Jourdan M, Martinez AM, Cavalli G, Moreaux J
Moriel-Carretero M, Pasero P, Pardo B
De Veirman K, Menu E, Maes K, De Beule N, De Smedt E, Maes A, Vlummens P, Fostier K, Kassambara A, Moreaux J, Van Ginderachter JA, De Bruyne E, Vanderkerken K, Van Valckenborgh E
Biernacka A, Zhu Y, Skrzypczak M, Forey R, Pardo B, Grzelak M, Nde J, Mitra A, Kudlicki A, Crosetto N, Pasero P, Rowicka M, Ginalski K
Coquel F, Neumayer C, Lin YL, Pasero P
Herviou L, Kassambara A, Boireau S, Robert N, Requirand G, Müller-Tidow C, Vincent L, Seckinger A, Goldschmidt H, Cartron G, Hose D, Cavalli G, Moreaux J
Bacal J, Moriel-Carretero M, Pardo B, Barthe A, Sharma S, Chabes A, Lengronne A, Pasero P
Sasi NK, Coquel F, Lin YL, MacKeigan JP, Pasero P, Weinreich M
Ashi MO, Srour N, Lambert JM, Marchalot A, Martin O, Le Noir S, Pinaud E, Ayala MV, Sirac C, Saulière J, Moreaux J, Cogné M, Delpy L
Herviou L, Cavalli G, Moreaux J
Coquel F, Silva MJ, Técher H, Zadorozhny K, Sharma S, Nieminuszczy J, Mettling C, Dardillac E, Barthe A, Schmitz AL, Promonet A, Cribier A, Sarrazin A, Niedzwiedz W, Lopez B, Costanzo V, Krejci L, Chabes A, Benkirane M, Lin YL, Pasero P
Bruyer A, Maes K, Herviou L, Kassambara A, Seckinger A, Cartron G, Rème T, Robert N, Requirand G, Boireau S, Müller-Tidow C, Veyrune JL, Vincent L, Bouhya S, Goldschmidt H, Vanderkerken K, Hose D, Klein B, De Bruyne E, Moreaux J
Cohen S, Puget N, Lin YL, Clouaire T, Aguirrebengoa M, Rocher V, Pasero P, Canitrot Y, Legube G
Fang D, Lengronne A, Shi D, Forey R, Skrzypczak M, Ginalski K, Yan C, Wang X, Cao Q, Pasero P, Lou H
De Smedt E, Maes K, Verhulst S, Lui H, Kassambara A, Maes A, Robert N, Heirman C, Cakana A, Hose D, Breckpot K, van Grunsven LA, De Veirman K, Menu E, Vanderkerken K, Moreaux J, De Bruyne E
Alaterre E, Raimbault S, Goldschmidt H, Bouhya S, Requirand G, Robert N, Boireau S, Seckinger A, Hose D, Klein B, Moreaux J
Pasero P, Vindigni A.
Pardo B, Crabbé L, Pasero P
Uzcanga G, Lara E, Gutiérrez F, Beaty D, Beske T, Teran R, Navarro JC, Pasero P, Benítez W, Poveda A
Viziteu E, Klein B, Basbous J, Lin YL, Hirtz C, Gourzones C, Tiers L, Bruyer A, Vincent L, Grandmougin C, Seckinger A, Goldschmidt H, Constantinou A, Pasero P, Hose D, Moreaux J.
Kassambara A, Jourdan M, Bruyer A, Robert N, Pantesco V, Elemento O, Klein B, Moreaux J.
Schoenhals M, Jourdan M, Bruyer A, Kassambara A, Klein B, Moreaux J.
Jourdan M, Robert N, Cren M, Thibaut C, Duperray C, Kassambara A, Cogné M, Tarte K, Klein B, Moreaux J.
Lin, YL., Pasero, P.
Alaterre E, Raimbault S, Garcia JM, Rème T, Requirand G, Klein B, Moreaux J.
De Veirman K, De Beule N, Maes K, Menu E, De Bruyne E, De Raeve H, Fostier K, Moreaux J, Kassambara A, Hose D, Heusschen R, Eriksson H, Vanderkerken K, Van Valckenborgh E.
Bret C, Viziteu E, Kassambara A, Moreaux J.
Lub S, Maes A, Maes K, De Veirman K, De Bruyne E, Menu E, Fostier K, Kassambara A, Moreaux J, Hose D, Leleu X, King RW, Vanderkerken K, Van Valckenborgh E.
Poli J, Gerhold CB, Tosi A, Hustedt N, Seeber A, Sack R, Herzog F, Pasero P, Shimada K, Hopfner KP, Gasser SM.
Viziteu E, Kassambara A, Pasero P, Klein B, Moreaux J.
Viziteu E, Grandmougin C, Goldschmidt H, Seckinger A, Hose D, Klein B, Moreaux J.
Jourdan M, Cren M, Schafer P, Robert N, Duperray C, Vincent L, Ceballos P, Cartron G, Rossi JF, Moreaux J, Chopra R, Klein B
Ogrunc M, Martinez-Zamudio RI, Sadoun PB, Dore G, Schwerer H, Pasero P, Lemaitre JM, Dejean A, Bischof O
Schoenhals M, Jourdan M, Seckinger A, Pantesco V, Hose D, Kassambara A, Moreaux J, Klein B.
Bastia D, Srivastava P, Zaman S, Choudhury M, Mohanty BK, Bacal J, Langston LD, Pasero P, O'Donnell ME
Seeber A, Hegnauer AM, Hustedt N, Deshpande I, Poli J, Eglinger J, Pasero P, Gut H, Shinohara M, Hopfner KP, Shimada K, Gasser SM.
Hassen W, Kassambara A, Reme T, Sahota S, Seckinger A, Vincent L, Cartron G, Moreaux J, Hose D, Klein B
Maes K, De Smedt E, Kassambara A, Hose D, Seckinger A, Van Valckenborgh E, Menu E, Klein B, Vanderkerken K, Moreaux J, De Bruyne E
Lapierre M, Castet-Nicolas A, Gitenay D, Jalaguier S, Teyssier C, Bret C, Cartron G, Moreaux J, Cavaillès V. J Hematol Oncol. 2015 Mar 4;8(1):20.
Seckinger A, Meißner T, Moreaux J, Benes V, Hillengass J, Castoldi M, Zimmermann J, Ho AD, Jauch A, Goldschmidt H, Klein B, Hose D.
Menolfi D, Delamarre A, Lengronne A, Pasero P, Branzei D.
Mejlvang J, Feng Y, Alabert C, Neelsen KJ, Jasencakova Z, Zhao X, Lees M, Sandelin A, Pasero P, Lopes M, Groth A.
Sheu YJ, Kinney JB, Lengronne A, Pasero P, Stillman B.
Magdalou I, Lopez BS, Pasero P, Lambert SA
Yoshida K, Bacal J, Desmarais D, Padioleau I, Tsaponina O, Chabes A, Pantesco V, Dubois E, Parrinello H, Skrzypczak M, Ginalski K, Lengronne A, Pasero P
Lengronne A, Pasero P.
Lin YL, Pasero P.
Crosetto N, Mitra A, Silva MJ, Bienko M, Dojer N, Wang Q, Karaca E, Chiarle R, Skrzypczak M, Ginalski K, Pasero P, Rowicka M, Dikic I
Yeeles JT, Poli J, Marians KJ, Pasero P.
Gourzones-Dmitriev C, Kassambara A, Sahota S, Rème T, Moreaux J, Bourquard P, Hose D, Pasero P, Constantinou A, Klein B.
Yoshida K, Poveda A, Pasero P.
Sokol AM, Cruet-Hennequart S, Pasero P, Carty MP.
Allera-Moreau C, Rouquette I, Lepage B, Oumouhou N, Walschaerts M, Leconte E, Schilling V, Gordien K, Brouchet L, Delisle MB, Mazieres J, Hoffmann JS, Pasero P, Cazaux C.
Wurtele H, Kaiser GS, Bacal J, St-Hilaire E, Lee EH, Tsao S, Dorn J, Maddox P, Lisby M, Pasero P, Verreault A.
Poli J, Tsaponina O, Crabbé L, Keszthelyi A, Pantesco V, Chabes A, Lengronne A, Pasero P.
Bianco JN, Poli J, Saksouk J, Bacal J, Silva MJ, Yoshida K, Lin YL, Tourrière H, Lengronne A, Pasero P.
Tittel-Elmer M, Lengronne A, Davidson MB, Bacal J, François P, Hohl M, Petrini JH, Pasero P, Cobb JA.
Lin YL, Pasero P.
Gongora, C., Vezzio-Vie, N., Tuduri, S., Denis, V., Causse, A., Auzanneau, C., Collod-Beroud, G., Coquelle, A., Pasero, P., Pourquier, P., Martineau, P., Del Rio, M
Tuduri, S., Crabbe, L., Tourrière, H., Coquelle, A., Pasero, P.
Tuduri, S., Tourrière, H., Pasero, P.
Bermúdez-López, M., Ceschia, A., de Piccoli, G., Colomina, N., Pasero, P., Aragón, L., Torres-Rosell, J.
Giannattasio M, Follonier C, Tourrière H, Puddu F, Lazzaro F, Pasero P, Lopes M, Plevani P, Muzi-Falconi M
Crabbe, L., Thomas, A., Pantesco, V., De Vos, J., Pasero, P. and Lengronne, A.
Tuduri, S., Crabbé, L., Conti, C., Tourrière, H., Holtgreve-Grez, H., Jauch, A., Pantesco, V., De Vos, J., Thomas, A., Theillet, C., Pommier, Y., Tazi, J., Coquelle, A., Pasero, P
Piwko, W., Olma, MH., Held, M., Bianco, JN., Pedrioli, PG., Hofmann, K., Pasero, P., Gerlich, DW., Peter, M
Poveda, AM., Le Clech, M., Pasero, P.
Alabert C, Bianco JN, Pasero P
Tittel-Elmer M, Alabert C, Pasero P, Cobb JA.
Marqués, M., Kumar, A., Poveda, AM., Zuluaga, S., Hernández, C., Jackson, S., Pasero, P., Carrera, AC.
Alabert, C., Poveda, A. and Pasero, P
Tuduri S, Crabbé L, Conti C, Tourrière H, Holtgreve-Grez H, Jauch A, Pantesco V, De Vos J, Thomas A, Theillet C, Pommier Y, Tazi J, Coquelle A, Pasero P.
Falbo, K.B., Alabert, C., Katou, Y., Wu, S., Han, J., Wehr, T., Xiao, J., He, X., Zhang, Z., Shi, Y., Shirahige, K., Pasero, P., Shen, X.
Tuduri, S., Tourrière, H., Pasero, P
Solovei, I., Pasero, P., Visa, N.
Zaidi, IW., Rabut, G., Poveda, A., Scheel, H., Malmström, J., Ulrich, H., Hofmann, K., Pasero, P., Peter, M., Luke, B.
Tourriere, H., Pasero Ph.
Torres-Rosell J, De Piccoli G, Cordon-Preciado V, Farmer S, Jarmuz A, Machin F, Pasero P, Lisby M, Haber JE, Aragon L.
Pillaire MJ, Betous R, Conti C, Czaplicki J, Pasero P, Bensimon A, Cazaux C, Hoffmann JS.
Flott, S., Alabert, C., Toh, GW., Toth, R., Sugawara, N., Campbell, DG., Haber, JE., Pasero, P., Rouse, J.
Luke, B, Versini, G, Jaquenoud, M, Zaidi, IW, Kurz, T, Pintard, L, Pasero, P, Peter, M.
Semple JW, Da-Silva LF, Jervis EJ, Ah-Kee J, Al-Attar H, Kummer L, Heikkila JJ, Pasero P, Duncker BP.
Tourriere, H., Versini, G., Cordon-Preciado, V., Alabert, C., Pasero, P.
Delamarre A, Barthe A, de la Roche Saint-André C, Luciano P, Forey R, Padioleau I, Skrzypczak M, Ginalski K, Géli V, Pasero P, Lengronne A
2019 - Mol Cell
, 77(2):395-410.e3 31759824
Service porteur :
Maintien de l'intégrité du génome au cours de la réplication
Herviou L, Cavalli G, Cartron G, Klein B, Moreaux J.
2016 - Oncotarget
, 7, 3, 284-296 26497210
Service porteur :
Chromatine et Biologie Cellulaire
Bret C, Klein B, Cartron G, Schved JF, Constantinou A, Pasero P, Moreaux J.
2015 - Br J Haematol.
, 169(2):296-9 25369781
Service porteur :
Instabilité Génétique et Cancer
Clifford R, Louis T, Robbe P, Ackroyd S, Burns A, Timbs AT, Colopy GW, Dreau H, Sigaux F, Judde JG, Rotger M, Telenti A, Lin YL, Pasero P, Maelfait J, Titsias M, Cohen DR, Henderson SJ, Ross M, Bentley D, Hillmen P, Pettitt A, Rehwinkel J, Knight SJ, Taylor JC, Crow YJ, Benkirane M, Schuh A.
2014 - BLOOD
, 123(7):1021-31 24335234
Service porteur :
Virologie Moléculaire
Kassambara A, Gourzones-Dmitriev C, Sahota S, Rème T, Moreaux J, Goldschmidt H, Constantinou A, Pasero P, Hose D, Klein B
2014 - Oncotarget
, 5(9):2487-98 24809299
Service porteur :
Instabilité Génétique et Cancer
Méchali M, Yoshida K, Coulombe P, Pasero P.
2013 - Curr Opin Genet Dev.
, 23, 2, 124-131. 23541525
Service porteur :
Réplication et Dynamique du Génome
Pillaire, M.J., Selves, J., Gordien, K., Gouraud, P.A., Gentil, C., Danjoux, M., Do, C., Negre, V., Bieth, A., Guimbaud, R., Trouche, D., Pasero, P., Méchali, M., Hoffmann, JS, and Cazaux, C
2010 - Oncogen
, 29, 6, 876-887 19901968
Service porteur :
Réplication et Dynamique du Génome