Phase separation and inheritance of repressive chromatin domains.
Akilli N, Cheutin T, Cavalli G
Le génome est plus qu'une suite linéaire de gènes. Il est compacté dans l’espace tridimensionnel du noyau cellulaire en structures tertiaires et quaternaires d'ordre supérieur. Les gènes flanquants s'organisent dans des domaines chromosomiques qui sont caractérisés par de types différents de chromatine, actifs ou répressifs.
Dans l'espace 3D, chaque site à l’intérieur d’un domaine contacte les autres sites à l’intérieur du domaine plus fréquemment que les sites d’autres domaines.
Cette propriété permet de définir les domaines physiques ou topologiquement associés (TAD). Au niveau du chromosome, les TAD individuels forment des contacts avec d'autres TAD, préférentiellement du même type, afin de construire des architectures 3D ordonnées appelées territoires chromosomiques. Enfin, différents chromosomes s'organisent de manière non aléatoire dans l'espace nucléaire.
Par conséquent, le génome eucaryote est hautement organisé en 3D et cette régulation peut être transmise ou modulée pendant la vie des cellules et des organismes. Cette chorégraphie chromosomique sophistiquée implique des milliers de différents acteurs - séquences d'ADN, ARNs et protéines - mais plutôt que de se combiner en un nombre infini de formes, ces composantes organisent un nombre relativement limité de types de chromatine, soit actifs, soit répressifs.
En particulier, deux groupes principaux de facteurs régulateurs du génome sont constitués par les protéines Polycomb (PcG) et Trithorax (trxG). Les protéines PcG maintiennent la mémoire des états silencieux de l'expression de gènes à travers la physiologie cellulaire et les divisions cellulaires multiples, tandis que les membres du trxG maintiennent des états actifs de la chromatine.
Ces protéines sont capables de reconnaître les états chromatiniens de leurs gènes cibles et de maintenir ces états au fil des divisions cellulaires même après la disparition des régulateurs transcriptionnels qui les ont induits en premier lieu. Remarquablement, ces états peuvent également être transmis à une fraction de la descendance au cours de plusieurs générations.
Dans notre laboratoire, nous visons à comprendre le principe régissant l'organisation du génome en 3D, ses implications fonctionnelles et les mécanismes moléculaires par lesquels les protéines PcG et trxG régulent leurs gènes cibles, transmettent l'héritage des états chromatiniens et orchestrent le développement.
Pour atteindre cet objectif, nous utilisons une variété d'approches et de techniques complémentaires dans les domaines de la biologie moléculaire, cellulaire et de développement, de la génomique et de la bioinformatique.
Akilli N, Cheutin T, Cavalli G
Gilbert G, Renaud Y, Teste C, Anglaret N, Bertrand R, Hoehn S, Jurkowski TP, Schuettengruber B, Cavalli G, Waltzer L, Vandel L
Parreno V, Loubiere V, Schuettengruber B, Fritsch L, Rawal CC, Erokhin M, Győrffy B, Normanno D, Di Stefano M, Moreaux J, Butova NL, Chiolo I, Chetverina D, Martinez AM, Cavalli G
Sabarís G, Fitz-James MH, Cavalli G
Ringel AR, Szabo Q, Chiariello AM, Chudzik K, Schöpflin R, Rothe P, Mattei AL, Zehnder T, Harnett D, Laupert V, Bianco S, Hetzel S, Glaser J, Phan MHQ, Schindler M, Ibrahim DM, Paliou C, Esposito A, Prada-Medina CA, Haas SA, Giere P, Vingron M, Wittler L, Meissner A, Nicodemi M, Cavalli G, Bantignies F, Mundlos S, Robson MI
Bourbon HG, Benetah MH, Guillou E, Mojica-Vazquez LH, Baanannou A, Bernat-Fabre S, Loubiere V, Bantignies F, Cavalli G, Boube M
Alaterre E, Ovejero S, Herviou L, de Boussac H, Papadopoulos G, Kulis M, Boireau S, Robert N, Requirand G, Bruyer A, Cartron G, Vincent L, Martinez AM, Martin-Subero JI, Cavalli G, Moreaux J
Chang JM, Weng YF, Chang WT, Lin FA, Cavalli G
Barral A, Pozo G, Ducrot L, Papadopoulos GL, Sauzet S, Oldfield AJ, Cavalli G, Déjardin J
Parreno V, Martinez AM, Cavalli G
Fitz-James MH, Cavalli G
Erokhin M, Chetverina O, Győrffy B, Tatarskiy VV, Mogila V, Shtil AA, Roninson IB, Moreaux J, Georgiev P, Cavalli G, Chetverina D
Ivana Jerkovic´ & Giacomo Cavalli
test1, test2
Szabo Q., Donjon A., Jerkovic I., Papadopoulos G.L., Cheutin T., Bonev B., Nora E., Bruneau B.G., Bantignies F., Cavalli, G.
Sati S., Bonev, B., Szabo, Q., Jost, D., Bensadoun, P., Serra, F., Loubiere
Loubiere V, Papadopoulos GL, Szabo Q, Martinez AM, Cavalli G
+
Chromatine et Biologie Cellulaire
Loubiere V, Papadopoulos GL, Szabo Q, Martinez AM, Cavalli G
+
Chromatine et Biologie Cellulaire
Pal K, Forcato M, Jost D, Sexton T, Vaillant C, Salviato E, Mazza EMC, Lugli E, Cavalli G, Ferrari F
+
Chromatine et Biologie Cellulaire
Pal K, Forcato M, Jost D, Sexton T, Vaillant C, Salviato E, Mazza EMC, Lugli E, Cavalli G, Ferrari F
+
Chromatine et Biologie Cellulaire
Cheutin T, Cavalli G
+
Chromatine et Biologie Cellulaire
Cheutin T, Cavalli G
+
Chromatine et Biologie Cellulaire
Jerković I, Szabo Q, Bantignies F, Cavalli G
+
Chromatine et Biologie Cellulaire
Jerković I, Szabo Q, Bantignies F, Cavalli G
+
Chromatine et Biologie Cellulaire
Giacomo Cavalli and Edith Heard
+
Chromatine et Biologie Cellulaire
Giacomo Cavalli and Edith Heard
+
Chromatine et Biologie Cellulaire
Szabo Q, Bantignies F, Cavalli G
Cardozo Gizzi AM, Cattoni DI, Fiche JB, Espinola SM, Gurgo J, Messina O, Houbron C, Ogiyama Y, Papadopoulos GL, Cavalli G, Lagha M, Nollmann M
Loubiere V, Martinez AM, Cavalli G
Herviou L, Jourdan M, Martinez AM, Cavalli G, Moreaux J
+
Maintien de l'intégrité du génome au cours de la réplication
Herviou L, Kassambara A, Boireau S, Robert N, Requirand G, Müller-Tidow C, Vincent L, Seckinger A, Goldschmidt H, Cartron G, Hose D, Cavalli G, Moreaux J
+
Maintien de l'intégrité du génome au cours de la réplication
Marti-Renom MA, Almouzni G, Bickmore WA, Bystricky K, Cavalli G, Fraser P, Gasser SM, Giorgetti L, Heard E, Nicodemi M, Nollmann M, Orozco M, Pombo A, Torres-Padilla ME
Cheutin T, Cavalli G
Herviou L, Cavalli G, Moreaux J
+
Maintien de l'intégrité du génome au cours de la réplication
Ogiyama Y, Schuettengruber B, Papadopoulos GL, Chang JM, Cavalli G
Szabo Q, Jost D, Chang JM, Cattoni DI, Papadopoulos GL, Bonev B, Sexton T, Gurgo J, Jacquier C, Nollmann M, Bantignies F, Cavalli G
Grob S, Cavalli G
Bonev, B., Mendelson Cohen, N., Szabo, Q., Fritsch, L., Papadopoulos, G., Lubling, Y., Xu, X., Hugnot, JP., Tanay, A., Cavalli, G.
Schuettengruber, B., Bourbon, HM., Di Croce, L., Cavalli, G.
Schauer T, Ghavi-Helm Y, Sexton T, Albig C, Regnard C, Cavalli G, Furlong EE, Becker PB.
Ciabrelli F, Comoglio F, Fellous S, Bonev B, Ninova M, Szabo Q, Xuéreb A, Klopp C, Aravin A, Paro R, Bantignies F, Cavalli G
Schwartz YB, Cavalli G.
Sati S, Cavalli G.
Cattoni DI, Gizzi AMC, Georgieva M, Di Stefano M, Valeri A, Chamousset D, Houbron C, Déjardin S, Fiche JB, González I, Chang JM, Sexton T, Marti-Renom MA, Bantignies F, Cavalli G, Nollmann M.
Bonev B, Cavalli G.
Leblanc B, Comet I, Bantignies F, Cavalli G.
Cheutin T, Cavalli G.
Loubière, V., Delest, A., Thomas, A., Bonev, B., Schuettengruber, B., Sati, S., Martinez AM., Cavalli, G.
Entrevan M, Schuettengruber B, Cavalli G
Herviou L, Cavalli G, Cartron G, Klein B, Moreaux J.
+ Maintien de l'intégrité du génome au cours de la réplication
Cavalli, G.
Le Goff E, Martinand-Mari C, Martin M, Feuillard J, Boublik Y, Godefroy N, Mangeat P, Baghdiguian S, Cavalli G
Ea V, Sexton T, Gostan T, Herviou L, Baudement MO, Zhang Y, Berlivet S, Le Lay-Taha MN, Cathala G, Lesne A, Victor JM, Fan Y, Cavalli G, Forné T.
Yung PY, Stuetzer A, Fischle W, Martinez AM, Cavalli G
Sexton, T., Cavalli, G.
Bousquet J, Anto JM, Berkouk K, Gergen P, Pinto Antunes J, Augé P, Camuzat T, Bringer J, Mercier J, Best N, Bourret R, Akdis M, Arshad SH, Bedbrook A, Berr C, Bush A, Cavalli G, Charles MA, Clavel-Chapelon F, Gillman M, Gold DR, Goldberg M, Holloway JW, Iozzo P, Jacquemin S, Jeandel C, Kauffmann F, Keil T, Koppelman GH, Krauss-Etschmann S, Kuh D, Lehmann S, Lodrup Carlsen KC, Maier D, Méchali M, Melén E, Moatti JP, Momas I, Nérin P, Postma DS, Ritchie K, Robine JM, Samolinski B, Siroux V, Slagboom PE, Smit HA, Sunyer J, Valenta R, Van de Perre P, Verdier JM, Vrijheid M, Wickman M, Yiallouros P, Zins M.
Ciabrelli F, Cavalli G.
Schuettengruber B, Oded Elkayam N, Sexton T, Entrevan M, Stern S, Thomas A, Yaffe E, Parrinello H, Tanay A, Cavalli G.
Bantignies, F., Cavalli, G.
Jost D, Carrivain P, Cavalli G, Vaillant C.
Gonzalez I, Mateos-Langerak J, Thomas A, Cheutin T, Cavalli G.
Cavalli, G.
Cheutin T, Cavalli G
Cavalli, G.
Bantignies, F.
Iovino N, Ciabrelli F, Cavalli G.
Sexton T, Cavalli G.
Cavalli, G., Mistelli, T.
Schuettengruber B, Cavalli G.
Tanay A, Cavalli G.
Cheutin T, Cavalli G.
Delest A, Sexton T, Cavalli G.
Sexton T, Yaffe E, Kenigsberg E, Bantignies F, Leblanc B, Hoichman M, Parrinello H, Tanay A, Cavalli G.
Cavalli, G.
Schuettengruber B, Martinez AM, Iovino N, Cavalli G.
Iovino, N., Cavalli, G.
Bantignies F, Cavalli G.
Hetzer, M., Cavalli, G
Cheutin, T., Bantignies, F., Leblanc, B., Cavalli, G.
Cavalli, G.
Comet, I., Schuettengruber, B., Sexton, T., Cavalli, G
Bantignies, F., Roure, V., Comet, I., Leblanc, B., Schuttengruber, B., Bonnet, J., Tixier, V., Mas, A., Cavalli, G.
Schuettengruber, B., Cavalli, G
Martinez, AM., Cavalli, G
Schuettengruber B, Cavalli G.
Sexton, T., Bantignies, F., Cavalli, G.
Martinez, AM., Schuettengruber, B., Sakr, S., Janic, A., Gonzalez, C., and Cavalli, G.
Schuettengruber B, Ganapathi M, Leblanc B, Portoso M, Jaschek R, Tolhuis B, van Lohuizen M, Tanay A, Cavalli G.
Reuter G, Cavalli G.
Mateos-Langerak J, Cavalli G
Portoso, M, and Cavalli, G.
Brasset E, Bantignies F, Court F, Cheresiz S, Conte C, Vaury C.
Lanzuolo C, Roure V, Dekker J, Bantignies F, Orlando V.
Cheutin, T., Sauvage, C., Tchélidzé, P., O
Cavalli, G.
Schuettengruber B, Chourrout D, Vervoort M, Leblanc B, Cavalli G.
Lanctot C, Cheutin T, Cremer M, Cavalli G, Cremer T
Negre N, Cavalli G.
Negre N, Lavrov S, Hennetin J, Bellis M, Cavalli G.
Grimaud C, Negre N, Cavalli G.
Comet I, Savitskaya E, Schuettengruber B, Negre N, Lavrov S, Parshikov A, Juge F, Gracheva E, Georgiev P, Cavalli G.
Negre N, Hennetin J, Sun LV, Lavrov S, Bellis M, White KP, Cavalli G.
Martinez AM, Cavalli G.
Martinez AM, Colomb S, Dejardin J, Bantignies F, Cavalli G.
Grimaud C, Bantignies F, Pal-Bhadra M, Ghana P, Bhadra U, Cavalli G.
Cavalli G.
Bantignies F, Cavalli G.
Déjardin, J., and Cavalli, G.
Déjardin, J., Rappailles, A., Cuvier, O., Grimaud, C., Decoville, M., Locker, D., and Cavalli, G.
Dejardin J, Cavalli G.
Akhtar A, Cavalli G
Aravin, A. A., Klenov, M. S., Vagin, V. V., Bantignies, F., Cavalli, G., and Gvozdev, V. A.
Déjardin, J., and Cavalli, G.
Melnikova, L., Juge, F., Gruzdeva, N., Mazur, A., Cavalli, G., and Georgiev, P.
Lavrov, S., Déjardin, J., and Cavalli, G.
Zraly, C. B., Marenda, D. R., Nanchal, R., Cavalli, G., Muchardt, C., and Dingwal, A.K.
Sun, L. V., Chen, L., Greil, F., Nègre, N., Li, T. R., Cavalli, G., Zhao, H., Van Steensel, B., and White, K.
Bantignies, F., Grimaud, C., Lavrov, S., Gabut, M., and Cavalli, G.
Cavalli, G.
Grienenberger, A., Miotto, B., Sagnier, T., Cavalli, G., Schramke, V., Geli, V., Mariol, M. C., Berenger, H., Graba, Y., and Pradel, J.
Cavalli, G., Paro, R.
Cavalli, G., Orlando, V., and Paro, R.
11) Cavalli, G., and Paro, R.
Soutenue par Quentin Szabo le 27/11/2019 sous la direction de Frédéric Bantignies et de Giacomo Cavalli
Soutenue par Vincent Loubière le 16/11/2018 sous la direction de Anne/Marie Martinez et de Giacomo Cavalli
par Marianne Entrevan le 29/09/2017 sous la direction de Giacomo Cavalli et de Bernd Schuttengruber
Defended by Filippo Ciabrelli on 16/12/2015 under the supervision of Giacomo Cavalli
Soutenue par Yuk Kwong Yung le 09/02/2015 sous la direction de Giacomo Cavalli
Anna Delest, 30/11/2012
Soutenue par Samy Sakr le 24/10/2011
Benjamin Leblanc, 23/06/2011
Bernd Stadelmayer 28/10/2010
Virginie Roure 10/12/2008
Itys Comet 20/11/2007
Nicolas Nègre 28/11/2005
Jérôme Déjardin 27/05/2004