ARN non codants, épigénétique et stabilité génomique

Dynamique du génome

Les éléments transposables (ETs) sont des séquences d’ADN répétées capables de se multiplier en insérant de nouvelles copies dans le génome qu’elles parasitent. L’hôte se défend contre ces envahisseurs grâce à un phénomène d’immunité qui a été découvert très récemment et qui est très conservé dans tout le monde vivant, des bactéries aux animaux. Au cœur de ce mécanisme, le RISC (RNA-interfering silencing complex) résulte de l’association d’une des protéines de la famille Argonaute avec un petit ARN non codant qui la guide vers sa cible ARN par homologie de séquence. Le ciblage d’un ARN messager dans le cytoplasme provoque généralement sa dégradation (post-transcriptional gene silencing : PTGS) tandis qu’on observe plutôt une répression épigénétique (transcriptional gene silencing : TGS) quand un ARN naissant est ciblé par le RISC dans le noyau.
Notre groupe s’intéresse à la biogenèse et la fonction des complexes piRISC composé de piARN (Piwi-associated small RNAs) et d’une protéine Argonaute dans le modèle Drosophile. Ces piARN sont codés par des loci hétérochromatiniens appelés « piRNA clusters ».

Figure 1

Biogenèse et role des piARN dans les cellules germinales de Drosophile

Nous avons notamment montré que la protéine Argonaute Piwi est requise de façon transitoire pendant le développement embryonnaire pour y déposer une marque hétérochromatinienne essentielle (triméthylation de la lysine 9 de l’histone H3) qui sera ensuite maintenue pendant tout le reste du développement.

Figure 2

Au laboratoire, nous utilisons les dernières approches de séquençage à haut débit (small RNA-seq, RNA-seq, ChIP-seq) et de protéomique (spectrométrie de masse), combinées avec des outils de génétique et de biologie cellulaire et moléculaire (CRISPR/dCas9) afin d’étudier le rôle complexe des piRISC.

Severine CHAMBEYRON

Chercheur

0434359949
Charlotte Grimaud
Charlotte GRIMAUD

Chercheur

0434359944
Alain PELISSON
Chercheur

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Mourdas Mohamed
Mourdas MOHAMED
IT

0434359944
Bruno MUGAT
Gestionnaire parc binoculaires et injection
IT

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Anais Lugagne
Anais LUGAGNE
Doctorant

0434359944
Marion Varoqui
Marion VAROQUI
Doctorant

0434359949

PUBLICATIONS DE L'ÉQUIPE

The Mi-2 nucleosome remodeler and the Rpd3 histone deacetylase are involved in piRNA-guided heterochromatin formation

Bruno Mugat, Simon Nicot, Carolina Varela-Chavez, Christophe Jourdan, Kaoru Sato, Eugenia Basyuk, François Juge, Mikiko C. Siomi, Alain Pélisson & Séverine Chambeyron

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Identification of misexpressed genetic elements in hybrids between Drosophila-related species

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Aubergine iCLIP Reveals piRNA-Dependent Decay of mRNAs Involved in Germ Cell Development in the Early Embryo

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Epigenetics and transgenerational inheritance

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